Den talentfulde jagerpilot Pete "Maverick" Mitchell (Tom Cruise) har et heftigt temperament og visse problemer med autoriteter, og på flyverskolen for luftvåbnets esser kæmper han desuden en intens kamp imod sin kølige - og knalddygtige - rival Tom "Iceman" Kazanski (Val Kilmer), der hele tiden minder ham om hans dumdristige pilotfars død i tjenesten. Samtidig tiltrækkes Maverick og den civile flyverinstruktør "Charlie" Blackwood (Kelly McGillis) uimodståeligt af hinanden, men spørgsmålet er, om en toppilot overhovedet har mulighed for at have et kærlighedsliv?

På 1800-tallet i New Mexico ble unge jenter kidnappet for å selges i Mexico. En av disse jentene er Lilly og hennes mor er desperat etter å få henne hjem, så desperat et hun er villig til å ta i mot hjelp fra sin egen far som forlot dem 20 år siden.

Efter mere end 30 års tjeneste som en af US Navy's bedste piloter, er Pete ”Maverick” Mitchell, hvor han hører hjemme – en modig testpilot, som konstant udvider grænserne og undgår den forfremmelse, som ville holde ham nede på jorden i stedet for oppe i luften. Mens han træner en gruppe afgangselever fra Top Gun til en specialopgave, som ingen pilot nogensinde har udført tidligere, møder Maverick løjtnant Bradley Bradshaw, også kaldet ”Rooster” - sønnen af Mavericks afdøde ven, radarofficeren løjtnant Nick Bradshaw, også kendt som ”Goose”.