Adam Clay har trukket seg tilbake fra rollen som Beekeper - en hemmelig statlig spesialstyrke som kalles inn når landet er i åpenbar fare eller lovene er utilstrekkelige. Da en venn plutselig tar sitt eget liv, oppdager Adam en konspirasjon på maktens tinder, der hensynsløse forretningsmenn systematisk har gått løs på de svakeste i samfunnet. Ingen ser ut til å være interessert i å ta gjerningsmennene, men Clay vil ikke la dem slippe unna med det igjen.

Travis Block er en farlig mann som lever og kriger i skyggen, for han frilanser for FBI som "opprydder", spesialisert på å redde agenter når infiltreringsforsøk slår feil. Block oppdager at et hemmelig program kalt Operation Unity rammer vanlige borgere av grunner som bare sjefen hans, FBI-direktør Robinson kjenner, og da får han hjelp av en journalist, men bakgrunn og begivenheter kolliderer når datteren og barnebarnet hans havner i skuddlinjen. Nå må Block redde menneskene han elsker og avsløre sannheten for å kunne stå frem med rak rygg. Alt og alle utgjør en trussel når noen skjuler hemmeligheter i Blacklight.